数据如何成就研究型医院未来
如何从50年的诊疗数据中发现梅奥专家的诊疗奥秘,是刘宏芳教授正在研究的,她说,“我希望通过大数据和人工智能去逆向思维,把梅奥专家做诊断的方法找出来。”作为梅奥为数不多的拥有博士学位的计算机科学家,她潜心研究生物医学和临床自然语言处理(NLP)及数据规范化,依托开源的NLP系统访问药物、EMR等临床信息,利用现有知识库实现高通量组学数据分析和功能转译。
精准医学的兴起,让医疗数据的宝贵价值终于受到世人瞩目。然而,如何从医疗数据中发现医疗的奥秘,并不是一件能够一蹴而就的事情。
梅奥医疗集团收集数据的传统始于20世纪初的患者病历索引,自1966至今梅奥保存了完整的患者诊疗队列研究数据,因此梅奥拥有从1966年至今的多种流行病研究方法,对附近居民的生老病死发展过程非常清楚。梅奥共有400多个系统(数据库)支撑业务发展,这些系统深入患者就诊期间的每一个环节, 通过语音识别实现医嘱录入的数字化确保病历数据质量精准可靠。
如何从50年的诊疗数据中发现梅奥专家的诊疗奥秘,是刘宏芳教授正在研究的,她说,“我希望通过大数据和人工智能去逆向思维,把梅奥专家做诊断的方法找出来。”作为梅奥为数不多的拥有博士学位的计算机科学家,她潜心研究生物医学和临床自然语言处理(NLP)及数据规范化,依托开源的NLP系统访问药物、EMR等临床信息,利用现有知识库实现高通量组学数据分析和功能转译。
世界著名的梅奥医疗集团共有64,000名员工,其中IT部门的规模已经超过3000人。在这个庞大的部门中不仅有顶尖的IT专家,还有来自临床、护理、医学科研等各个领域的专家、学者,共同引领梅奥基于IT的科研、临床及教学信息化研究项目。
梅奥需要如此庞大的IT部门吗?
“虽然让梅奥的IT系统运转起来不需要如此庞大的IT部门,然而想成就研究型医院的未来,我们需要更多优秀的医学信息学人才支撑梅奥的发展。”梅奥的刘宏芳教授提到她带领的医学信息学团队十分骄傲,她说,作为一家“患者体验至上”的医院梅奥在信息化建设方面同样追求精益求精,特别的是在患者体验方面不断追求更佳体验。
梅奥管理层非常重视来自信息化部门的提案。“在梅奥我们经常跟诊所领导们讨论我们的项目,因为我们需要梅奥投资支持我们的项目,梅奥同样需要我们从数据中洞察未来医学走向,并推动未来医疗的崭新模式快速落地。”
从事研究工作多年,刘宏芳教授非常喜欢这里的研究环境,因为梅奥是医、教、研一体的综合型医疗保健系统,既有对于医学研究的重视又有一线数据及应用场景去实践和验证。此外,梅奥在跨科室协同研究方面非常有经验,从临床业务的多学科联合会诊,到医学信息学项目中科研专家、临床医生、IT专家等跨领域专家的协同攻坚都已形成一套科学的协作体系,确保各个领域顶尖资源能够共同在项目研究中释放最大潜力。
在这一背景下,拥有丰富研究经验和知识理论的刘宏芳教授和她的团队可谓如鱼得水,他们一方面观察业务流程中有成长空间的环节,另一方面基于丰富的跨学科学历背景引入先进的研究模式,精准定位IT助推医疗项目发展的契机与途径。下面两个例子能够让我们理解梅奥的IT研究模式。
随着大数据、人工智能的兴起,不少IT公司正在鼓吹智能医疗的概念,希望依托临床知识库实现智能临床诊断。“这种模式充其量只能算是辅助诊断,根本不能实现智能诊断。”刘宏芳教授告诉记者,因为作为诊断决策的知识库往往都是临床基础知识,或者科研文献,不少文献的结果甚至是相持的,根本无法支撑临床医生找到诊疗的关键点;而专家看病不仅需要对病症、药物和患者病史等材料有基本了解,更需要用自己的判断模式逐步完成科学判断然后对症下药。如果只有基础知识库根本无从得出结论,因为机器没有学会专家“如何诊断”,又如何支撑医生诊断呢?
那么,如何从专家诊疗数据中找出专家诊疗的奥秘,并传递给更多医生呢?梅奥拥有丰富的专家资源,在大量的患者诊疗案例中追踪专家诊疗行为并研究他们的诊疗流程和判断准则,逆向倒推每一步决策后分析决策依据构建知识库,搭建机器学习培养环境找到专家诊断的奥秘,有望实现临床专家诊疗方法和经验传承与普及,加速梅奥知识的价值输出。
精准医学时代,支撑精准医学的数据涵盖基因数据、医疗机构数据、日常生活数据等多层次、多维度数据,面对数据准确性、数据完整性等诸多方面问题,真正能够支撑精准医学的数据能有多少呢?
“梅奥对于患者数据的要求十分严谨,”刘宏芳教授说,从患者进入梅奥开始,患者个人信息、检验、诊断、治疗中的每一个环节都被精准记录,加上出院后科学严谨的每周一次随访记录,每一份梅奥患者的病历都是完整的疾病诊疗全记录,对于临床科研工作者来说无疑都是最宝贵的财富,因为通过这些数据可以有效实现诊疗方案的评价、优化,找到诊疗能力提升的入口。
然而,要获得这样一份数据并不容易,不仅要有科学的诊疗随访体系及配套数据采集规范,更需要科学的数据采集和管理体系。梅奥对待数据的严谨态度始终如一,通过建立标准化疾病诊疗知识库,对各类疾病进行标准化描述,包括诊断、治疗方案、用药、预后,并以此为基础建立标准化的临床路径。同样,这套标准化的数据库,也为临床科研人员提供了更加可靠的科研数据,确保科研结果的有效性。
作为一家研究型医院,梅奥在罕见病方面的资源不仅丰富而且准确,基于严谨的疾病知识库体系的疾病诊疗知识库发现罕见病治疗的突破口,让梅奥更有信心抓住精准医学新机遇在罕见病研究领域实现突破。
在梅奥的6年间,刘宏芳教授已经主导了多个项目,她希望能够以数据之力保持梅奥在临床科研及教学领域的先进性,持续提升梅奥服务品质。为了实现这个目标,她将自己多年所学的数学、生物医学信息学等专业知识充分释放出来,从过去的研究经历中积累的研究方法和体系落实到梅奥,一步一步去实现数据支撑医教研发展的目标,赢得了梅奥医学专家及IT同仁们的广泛支持和合作,使信息化俨然成为全诊所上下的重要枢纽。
当然,平等对话总是在拥有话语权的前提之下,从纯粹做项目研究到支撑梅奥发展整体规划,刘宏芳教授坦言,她的话语权得益于跨越科知识储备、对于业务细心专研以及对于助推医学发展的渴望。
对于医院IT部门的从业人员来说,数据是有的,方法也都是现成的,缺少的恰恰是IT跟医学的结合点。在医院的环境中,医生不懂计算机,计算机人才又不懂医学,因此,跨领域复合人才是决定医疗大数据发展的关键。
机遇总是留给有准备的人。随着精准医学时代的到来,生物医学信息学迎来新的机遇:从数据中发现诊疗方案优化的趋势,从数据中发现罕见病诊疗的突破口,机遇就在面前,能否抓住机遇落在医院IT人的肩头,只有建立科学的数据采集与管理体系,搭建起数据支撑临床、科研发展的路径,才能借助精准医学实现研究型医院科技兴医的梦想。
对于医院IT人来说,精准医学不仅是医学腾飞的关键期,同样也是医学信息人谋求自身发展的机遇期。刘宏芳教授说,“医院要抓住精准医学这一机遇期实现跨越式发展必须从数据阶段就要做好充足准备,在这一重要历史时期,医学信息化人才的重要性不言而喻。”抓住精准医学机遇全面提升自己,不仅能够帮助所在医院实现全面发展,也将为医学信息学人才在精英荟萃的研究型医院战场赢得一席之地。
精准医学正在为医学信息学人才敞开怀抱,中国医院CIO你们准备好了吗?!